Вниз
Скачать: CL | DM;

Поиск в файле   Найти похожие ветки 

 
SinnerPro   (2003-01-19 09:52) [0]

Вот. В общем дан файл, размером ~2,5-3 Mb. Надо, из него вытянуть количество последовательностей из 3х определенных букв. Файл содержит абсолютно все символы. Расстояние между последовательностями разное, в среднем от 5000 до 45000 символов. Желательно чтобы это происходило достаточно быстро, медленно я сам сделать могу ;).


 
Song ©   (2003-01-19 10:39) [1]

BlockRead+цикл будет вполне быстро
или через наследнные классы от TStream, если только чтение нужно.


 
Романов Р.В. ©   (2003-01-19 10:47) [2]

Читай файл в буфер целиком или кусками. Ищи последовательность в цикле.


 
SinnerPro   (2003-01-19 11:07) [3]

Song: Романов Р.В:

Да я пробывал, все равно тормазно как-то... ну если никак подругому нельзя, то ладно


 
Романов Р.В. ©   (2003-01-19 11:54) [4]

Можно несколько ускорить процесс поиска если проверять не все байты, а через 3. Для этого нужно получить маску.
b: Byte;
...
b :=(Ord("A") or Ord("G") or Ord("T")) xor $FF;

Сравниваешь каждый третий байт с этой маской
if (CurentByte and b) = 0 then
// Более точная проверка в окрестностях этого байта.

При некоторых условиях способ может оказаться медленнее прямого перебора.



Страницы: 1 вся ветка

Скачать: CL | DM;



Память: 0.45 MB
Время: 0.01 c
14-87101
Ru
2003-01-09 13:36
2003.01.27
Референдум на.


3-86676
seacat
2003-01-08 17:03
2003.01.27
Индикатор хода выполнения при запросе к БД


8-86966
Asderg
2002-10-08 08:25
2003.01.27
как сделать из double вычислений вычисления с фикс точкой.


1-86788
HappyNewYearToAll
2003-01-16 14:34
2003.01.27
Memo


1-86918
Andrey V.
2003-01-16 15:20
2003.01.27
dinamyc arrays




   Наверх